lundi 20 juin 2011

"Génome - voyage au cœur du vivant", désormais au CMU.

Même si on y est allé, même si on n'y est pas allé, même pour les nombreux lecteurs internationaux de ces Bio-Tremplins cette expo offre des retombées éducatives intéressantes. Notamment les "gènes de la semaine" qui font vivre ce génome en illustrant un gène par jour avec une interview d'un spécialiste sur un gène par semaine

Rendre vivant le génome...

Pour les élèves le génome reste très abstrait, surtout en tant que séquence. Or ces séquences sont de plus en plus la "matière à expérimenter " des chercheurs. Au coeur de la biologie actuelle,on glisse d'un ADN vu comme molécule vers un ADN vu comme séquence ! Prendre conscience de la place centrale que ces séquences occupent dans la façon de pratiquer la biologie, discuter comment et où intégrer ces nouvelles approches de la biologie dans les cours sont des questions qu'on ne peut bientôt plus éluder...  Elle avait fait l'objet d' une publication Bio-Tremplin de février 2010 

L'expo "Génome - voyage au cœur du vivant" qui avait été un succès phénoménal durant le 450 de l'unige est à nouveau disponible, au CMU




Génome CMU



Bonjour à toutes et à tous,

Nous vous invitons à venir découvrir ou redécouvrir l'exposition "Génome - voyage au cœur du vivant"
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L'exposition "Génome - voyage au cœur du vivant" élit domicile au Centre médical universitaire dès le 9 juin prochain. Conçu par les généticiens de l'UNIGE  et réalisé par le scénographe François Confino, le contenu du noyau géant, qui a occupé l'île Rousseau durant quatre mois et demi à l'occasion du 450e  anniversaire de l'Université, va retrouver une nouvelle vie à la Faculté de médecine.
Le franc succès qu'avait rencontré l'exposition en 2009, avec plus de 127 000 visiteurs, dont 1300 élèves – tous niveaux d'enseignement confondus, a poussé l'UNIGE, en collaboration avec l'un des principaux partenaires de l'exposition – les HUG – à pérenniser cette installation en tant qu'instrument pédagogique  et de vulgarisation scientifique.
Le visiteur pourra donc découvrir, ou redécouvrir, l'univers fascinant du plan de fabrication de chaque individu, à travers différents éléments de l'exposition  que sont la fresque graphique, les mises en scène, la monumentale sculpture lumineuse de l'hélice d'ADN, les films d'animation scientifique et, bien sûr, le journal lumineux sur lequel défile l'intégralité du génome humain.

Cordialement

Sophie Hulo

mardi 14 juin 2011

Bio-tremplins : Votre avis nous est indispensable !

Presque une fois par semaine,  vous recevez les Bio-Tremplins. 
Pour faire un bilan sur ce qu'ils vous ont apporté, je vous invite donc à  remplir le questionnaire ici (5 minutes ?)
Il vise à connaitre votre avis afin d'optimiser l'adéquation de cette publication électronique avec vos besoin.

Je vous encourage à y répondre ... d'autant plus que la question de la reconduction des Bio-Tremplins n'a pas encore reçu de réponse claire.

… dans le fond que sont les Bio-Tremplins ?

La discipline de référence biologie subit une profonde mutation et les connaissances augmentent énormément : l’enseignement doit prendre en compte cette évolution. Cette publication électronique a été renommée Bio-Tremplins pour se distinguer d’un review qui « ferme le sujet » et mettre en évidence son rôle d’ouverture et d’incitation à accéder à la littérature primaire. Cette publication électronique veut être un lien, un tremplin entre la recherche, l'université et les maîtres de biologie. Sans tenter de vulgariser encore une fois ce qui l'est déjà dans des revues excellentes, il s'agit de sélectionner, de rassembler des recherches disparates sur un thème et de les mettre en perspective, mais aussi de faciliter pour les maîtres l'accès à la source des informations. Elle veut aussi être un pas – modeste – pour mettre au point les nouvelles façons dont les connaissances se construisent dans une société en mutation où la capacité à accéder à l'information et à se construire ses des connaissances est décisive et nécessite de nouvelles compétences.

L'an passé un tel questionnaire avait été proposé et le Bilan des Bio-Tremplins 2010 est ici.

lundi 6 juin 2011

Les cônes, les bâtonnets et... les ipRGC !

Si on ne les cherche pas on ne trouve pas d'autres photorécepteurs

Fig 1 : En plus des cônes et des bâtonnets, notre rétine contient des cellules ganglionnaires sensibles à la lumière : ipRGC illustrés en bleu.  [img]Source :   Lok, Corie. (2011)

Dans une Feature News de Nature, Corie Lok (2011) Obtenir cet article : Get-a-doi discute une découverte récente Zaidi, F. H. et al. (2007) qui remue le domaine de la recherche sur la vision. Certaines des cellules ganglionnaires de la rétine contiennent de la mélanopsine et sont sensibles à la lumière ( surtout bleue). Leur fonction d'intégration des influx depuis les cônes et bâtonnets avait masqué leur rôle de photorécepteurs. Ils participeraient aux rythmes circadiens, à la détection des niveaux de lumière ambiante et pourraient même activer certains apprentissages. La question des effets de certaines lumières ambiantes colorées sur la physiologie et le comportement - un peu suspecte jusqu'à récemment - est en pleine recherche et reprend de la respectabilité.    
Un jour une femme complètement aveugle depuis 50 ans suite à une maladie génétique qui avait détruit ses cônes et bâtonnets dit voir une sorte de lueur faible quand un panneau s'éclaire de bleu.  Russell Foster - un des auteurs à l'uni d'Oxford- dit Zaidi, F. H., et al. (2007) Obtenir cet article : Get-a-doi  dit avoir été complètement bluffé . On connaissait les ipRGC depuis 2002, mais on pensait qu'il servaient seulement à synchroniser l'horloge circadienne.

Comment distinguer une cellule photosensible d'une qui intègre les influx d'autres cellules photosensibles ?

Ce qui a rendu difficile la découverte de ces cellules ganglionnaires est que le modèle dans lequel on travaillait expliquait aussi très bien les données : ces cellules intègrent en effet les influx de plusieurs photorécepteurs : ce n'est pas très facile à distinguer d'une photo-réception propre. Il a fallu que des données discordantes : Forster dans les années 1990 découvre que des souris dont la rétine dégénérait avaient une réponse circadienne à la lumière indistinguable des souris normales. Mais les yeux étaient bien nécessaires à cet effet.   Le scepticisme a été très grand au début : lors des premières conférences de Forster des chercheurs se sont levés et sont sortis de la salle ! Même (surtout?) chez les chercheurs du domaine on avait perdu de vue que toute connaissance scientifique repose sur des données et que de nouvelles données peuvent remettre en question une certitude pourtant considérée comme solide.  En sciences Astolfi rappelle que  " les « faits» sont des interprétations qu'on ne remet plus en question, souvent parce qu'on a oublié (individuellement et collectivement) par quel découpage du monde ils ont été construits." Astolfi, J. P. (2008)

Trébuche mais avance ...

Finalement l'idée a fait son chemin... et une course de vitesse s'est terminée ex-aequo avec d'autres chercheurs: Hattar, S., et al (2002) Obtenir cet article : Get-a-doi qui ont aussi  montré que 1% des cellules de la couche ganglionnaire expriment la mélanopsine chez la souris et on sait que c'est moins encore chez l'humain.
Ce que Zaidi, et al. montrent est que les effets vont beaucoup plus loin : contraction des pupilles, suppression de la mélatonine, augmentation de la vigilance, et même conscience de la lumière. Ils disent avoir mis en évidence des effets sur :"circadian, neuroendocrine, and neurobehavioral responses to light, and even visual awareness of light " . Ces effets sont maximaux dans le bleu ( 480 nm) où les ipRGC sont les plus sensibles cf figure 2.
 
Fig 2 : Spectres des cônes, bâtonnets et les "nouveaux"  ipRGC-   [img]Source : Lok, Corie. (2011)

Des effets sur l'apprentissage ?

Steven Lockley et ses collègues, à la Brigham and Women's Hospital à Boston, ont testé les temps de réaction de 16 volontaires sains exposés à de la lumière bleue ou verte durant 6.5 heures. Ceux exposés à la lumière bleu ont eu des temps de réaction plus rapides moins d'erreurs d'inattention. Cela ouvre un potentiel de manipuler la lumière ambiante pour être plus efficace. Mais pose la question des effets de longueurs d'ondes auxquelles notre évolution ne nous a pas préparés avertit Van Gelder, neurobiologiste et ophtalmologue à l'University of Washington, Seattle. . "Alors que les éclairages LED riches en bleu se généralisent nous avons besoin de réponses rapides !"

Une question collatérale pour exploser les esprits curieux...

Sur la figure 2, le spectre des cônes rouges n'est pas aussi simple que celui de nombreux ouvrages scolaires. Pourrait-il y avoir un lien avec la représentation en roue des couleurs : le cercle chromatique. Une représentation sur laquelle repose une part essentielle des arts graphiques, de l'impression et des affichages de toutes sortes. Une circularité qu'on prend pour un fait établi sans en discuter les causes.



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En somme pourquoi un spectre ( linéaire ) devient-il circulaire dans la perception humaine des couleurs ? Ou, pour mettre sur la piste : pourquoi est-ce qu'ajouter du rouge au bleu donne-t-il l'impression du violet ?


Bonne nuit .-)) P.S. N'imaginez pas que j'ai une réponse définitive, c'est une vrai question ouverte pour moi.

Sources


  • Astolfi, J. P. (2008). La saveur des savoirs. Disciplines et plaisir d'apprendre. Paris: ESF.
  • Foster,r.G.et al.J.Comp.Physiol.A169,39–50 (1991).
  • Hattar, S., Liao, H.-W., Takao, M., Berson, D. M. & Yau, K.-W. Science 295, 1065-1070 (2002). | Article | PubMed DOI: 10.1126/science.1069609  intranet.pdf
  • Lockley, S. W. et al. Sleep 29, 161-168 (2006). | PubMed
  • Lok, Corie. (2011). Vision science: Seeing without seeing | Nature News Feature 469, 284-285  19 January 2011| doi:10.1038/469284a
  • Zaidi, F. H., Hull, J. T., Peirson, S. N., Wulff, K., Aeschbach, D., Gooley, J. J., Brainard, G. C., et al. (2007). Short-Wavelength Light Sensitivity of Circadian, Pupillary, and Visual Awareness in Humans Lacking an Outer Retina. Current Biology, 17(24), 2122-2128. doi:16/j.cub.2007.11.034
    Download a PDF of this article.

Accès aux articles scientifiques offert par la faculté des sciences aux enseignants:

La plateforme Expériment@l vous offre la possibilité d'obtenir ces articles : Get-a-doi

Expériment@l, des données authentiques, 3 éclairages!

jeudi 2 juin 2011

Papillons nocturnes et dessin


Les sphinx, des insectes hors catégorie, les voir, les dessiner.

Parmi les papillons, les sphinx sont souvent impressionnants, par leur taille, leurs motifs, leur apparence.

Fig 1 : Une espèce de cheniile de sphinx, sauf erreur  de l'euphorbe[img] [img]Source : F.Lombard  
Pour une fois que les animaux extraordinaires ne sont pas à l'autre bout de la planète dans des climats et des lieux dignes d'Indiana Jones, profitons de la présence d'experts pour mieux les connaitre parmi  de nombreux autres insectes nocturnes. Les naturalistes romands Logo Naturalistes Romandsproposent une formation locale qui aidera à se sortir des corrections et des élèves râleurs...

Fig 2 : Une espèce de chenille de sphinx, sauf erreur sphinx de la vigne. [img] [img]Source : F.Lombard  


Titre         Naturalistes Romands Amis des sphinx et des pâquerettes (par exemple), bonjour.
Je profite de ce petit mot (quasi) printanier pour vous dire qu'il reste quelques petites places pour la fameuse excursion nocturne de ce vendredi soir 3 juin (21h00-24h00). Nous partirons à la recherche des sphinx avec le dessinateur et graveur Pierre Baumgart. Avec un drap blanc et une lumière, nous parcourrons le jardin botanique de Genève et nous y apprendrons à observer et à dessiner les papillons de nuits de par chez nous. Surprises colorées garanties. (Aucun besoin de savoir dessiner pour venir ; cherchez une autre excuse...  ) N'hésitez donc pas à vous inscrire ! A très bientôt j'espère ! Laurent Burgisser www.naturalistes-romands.ch