L'expo génome voyage au coeur du vivant - 106'000 visiteurs et des ressources pour enseigner !

L'expo génome humain bientôt finie mais durable !

Ile Rousseau http://www.unige.ch/genome

L'exposition sur le génome humain a attiré un public très abondant : plus de 106'000 visiteurs l'ont déjà visitée ! Il reste encore quelques jours pour en profiter....
PROLONGATIONS JUSQU’AU 28 FEVRIER 2010

Fig 1 : Le nombre de participants avait déjà dépassé les 100'000 à fin janvier : beau succès ! [img]Source C. Brockmann

Même si on y est allé, même si on n'y est pas allé, même pour les nombreux lecteurs internationaux de ces Bio-Tremplins cette expo offre des retombées éducatives intéressantes. Notamment les "gènes de la semaine" qui font vivre ce génome en illustrant un gène par jour avec une interview d'un spécialiste sur un gène par semaine

Rendre vivant le génome...

Pour les élèves le génome reste très abstrait, surtout en tant que séquence. Or ces séquences sont de plus en plus la "matière à expérimenter " des chercheurs. Au coeur de la biologie actuelle,on glisse d'un ADN vu comme molécule vers un ADN vu comme séquence ! Prendre conscience de la place centrale que ces séquences occupent dans la façon de pratiquer la biologie, discuter comment et où intégrer ces nouvelles approches de la biologie dans les cours sont des questions qu'on ne peut bientôt plus éluder...

Il y avait eu l'expo de Chromosome Walk

Chromosome walk.

En 2008 l'ISB avait fait une expo plus modeste mais tout à fait remarquable aussi et qui propose encore des ressources pour illustrer les gènes notables sur chaque chromosome : le gène qui nous rend la vitamine C nécessaire sur le Chr 8 par exemple. Cf. Quelques caractéristiques des chromosomes humains à disposition)

Cette exposition "génome voyage au coeur du vivant" propose des ressources bienvenues

Par exemple pour la semaine de Noel nous avions 7 gènes qui pourraient intéresser les élèves :

Lundi 21 décembre		Le gène HERC2 associé à la couleur bleue des yeux.
Mardi 22 décembre		Le gène HEXA impliqué dans la maladie de Tay-Sachs.
Mercredi 23 décembre		Le gène HBA1 est défectueux chez les individus atteints d'alpha-thalassémie.
Jeudi 24 décembre		ABCC11 code pour une protéine impliquée dans la qualité (grasse ou sèche) du cérumen (cire de l'oreille).
Vendredi 25 décembre		Le gène MC1R est impliqué dans la couleur de la peau, des cheveux et des yeux. En savoir plus sur MC1R
Samedi 26 décembre		5-HTT code pour le transporteur de la sérotonine. En savoir plus sur 5-HTT
Dimanche 27 décembre		Des mutations dans le gène BRCA1 sont à l'origine de formes héréditaires du cancer du sein.

Le gène d'accord... mais nous voyons et vivons de protéines !

Effectivement ce tableau - destiné au grand public - renforce la confusion entre gène et protéine correspondante en présentant des caractéristiques phénotypiques à côté du nom du gène. Vous saurez faire la différence, mais les élèves auront probablement besoin d'être aidés à faire cette distinction.

Du nom du gène à la fonction, aux séquence et aux phénotypes

A partir du nom du gène on peut accéder aux informations de séquence, sur la fonction de la protéine correspondante, etc dans la base UniProt

• Par exemple, pour le 27, le tristement célèbre BRCA1 (prononcer braca) est répertorié ici P38398 (BRCA1_HUMAN)
• On y apprend qu'il est impliqué dans la réparation d'ADN et le maintien de l'intégrité génomique. Plus de détails dans le § Function
• Un lien sur OMIM 113705 complète avec "BRCA1 plays critical roles in DNA repair, cell cycle checkpoint control, and maintenance of genomic stability. "

L'ouvrage de référence on-line Genes and Diseases donne un très bon résumé des effets de ce gène quand il est muté sur les risque de cancer du sein.ici Ainsi on peut accéder à de nombreux exemples qui rendront plus authentiques nos cours

Quels risques BRACA1 ?

Pour connaitre ce risque le nom du gène permet de trouver au national cancer institute que :

• Le risque d'avoir un cancer du sein au cours de la vie est de 12%, en général, il est de 60% pour les femmes portant une mutation défavorable de BRCA1
• Le risque est aussi accru pour les hommes

Gageons que ce gène-là intéressera les élèves, mais aidons-les à ne pas paniquer et prenons garde au fait qu'il risque d'y avoir dans les classes les élèves dont les proches ont souffert ou souffrent de cancer du sein !

Le gène de la couleur de la peau ?

Pour le jour de noël : "Le gène MC1R est impliqué dans la couleur de la peau, des cheveux et des yeux. En savoir plus sur MC1R" On y accède à une petite vidéo (2:24) du Prof. Milinkovitch Il décrit avec une clarté remarquable la manière dont les mutations de ce récepteur de la mélanocortine de type 1 changent la couleur des poils des plumes et de de la peau chez divers animaux dont les humains. Cette vidéo peut être exploitée comme document pour discuter de l'unité du vivant qui est mise en évidence par l'unicité de ce mécanisme à travers le monde des vertébrés.

Une petite vidéo par semaine !

Il y a ainsi de très nombreuses petites vidéos faites avec TSR découvertes où un-e chercheur-e rend vivant un gène en parlant des effets de la protéine correspondante.

• Gène codant pour la protéine SRY qui induit le développement des testicules. En savoir plus sur SRY
• VNR1R1 code pour un récepteur aux phéromones présent dans la muqueuse nasale chez l'humain. En savoir plus sur VNR1R1
• Un télomère est une région d'ADN répétitif, aux extrémités d'un chromosome, qui protègent ces extrémités. Ils sont comparés au morceaux de plastique, présents au bout des lacets, qui les empêchent de se dérouler. Les télomères sont pour la plupart encore non-séquencés. En savoir plus sur les télomères
• Le gène SRP54 est important pour l'adressage des protéines nouvellement produites. En savoir plus sur SRP 54
• etc.

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On peut retrouver les gènes de la semaine depuis le site mais aussi dans cette liste

• semaine 1
• semaine 2
• semaine 3
• semaine 4
• semaine 5
• semaine 6
• semaine 7
• semaine 8
• semaine 9
• semaine 10
• semaine 11
• semaine 13
• semaine 14 (bientôt)
• semaine 15 (bientôt)
• semaine 16 (bientôt)

Souhaitons que ces ressources restent disponibles encore longtemps.

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