Or le SIB (Institut Suisse de Bioinformatique) (avec qui nous avons collaboré pour développer des formations continues sur la bioinformatique depuis 2004) vient de mettre en ligne le site Precisionmed.ch1. Ce site fournira de précieuses informations aux enseignants et aux élèves pour mieux comprendre cette évolution récente qui s'appuie sur la bioinformatique, mais aussi la dimension humaine des médecins et d'autres compétences réunies dans des équipes appelées Tumor Board Moléculaire.
Les auteurs de ce projet ont sélectionné pour 
un très bon review :
Fig 1:Les divisions cellulaires mitotiques de l'œuf fécondé à une cellule dans un cancer, indiquant le timing des mutations somatiques acquises par la cellule cancéreuse et les processus qui y contribuent [img]. Source : Stratton, M. R., Campbell, P. J., & Futreal, P. A. (2009)
un très bon review :- Stratton, M. R., Campbell, P. J., & Futreal, P. A. (2009). The cancer genome. Nature, 458(7239), 719‑724. https://doi.org/10.1038/nature07943
1 . en collaboration avec l'Université de Lausanne et le CHUV – dans le cadre de l'initiative SantePerso (www.santeperso.ch).
Cette 'nouvelle' médecine soulève de nombreuses questions : Comment le patient est-il pris en charge? Quelles sont les approches? Quel est le rôle de la bioinformatique? Quels sont les défis? Quels sont les enjeux et quelles sont les limites?
-->La médecine de précision
Pourquoi un tel site ? La médecine dite de précision s'appuie sur les nouvelles technologies pour identifier une stratégie thérapeutique adaptée à l'histoire et aux données génétiques de chaque patient. En oncologie, la médecine de précision est déjà une réalité.
Cette 'nouvelle' médecine soulève de nombreuses questions : Comment le patient est-il pris en charge? Quelles sont les approches? Quel est le rôle de la bioinformatique? Quels sont les défis? Quels sont les enjeux et quelles sont les limites?
Le site PrecisionMed.ch propose un résumé des concepts biologiques en un dessin, un glossaire, des dossiers pour comprendre l'importance des protéines lorsque tout va bien ou lors d'une maladie comme le cancer (C'est quoi une protéine? C'est quoi une mutation?), deux exemples concrets de traitement ciblé (Un exemple de chimiothérapie ciblée Un exemple d'immunothérapie ciblée), des dossiers pour comprendre le rôle incontournable de la bioinformatique face à la quantité et à la complexité croissantes des données biomédicales générées par les nouvelles technologies (C'est quoi un profil génétique?) et/ou le rôle des outils de prédiction lorsqu'aucune information n'est disponible sur l'impact d'une mutation, aussi bien en recherche qu'en clinique (C'est quoi la modélisation moléculaire?).
Et finalement, des vidéos avec des interviews de patients et des différents experts du Tumor Board Moléculaire (TBM) du réseau romand d'oncologie : biologistes, médecins, bioinformaticiens, … (En images). Le TBM utilise justement ces nouvelles technologies pour proposer une stratégie thérapeutique 'sur mesure' aux patients : il suit plusieurs centaines de patients chaque année depuis 2016.
A vous de jouer! Un atelier pour découvrir pas à pas les différentes étapes des analyses effectuées (du séquençage de l'ADN à l'interprétation des résultats) est à votre disposition: http://education.expasy.org/bioinformatique/pdfs/A_vous_de_jouer.pdf
Le site Precisionmed.ch a été développé par le SIB Institut Suisse de Bioinformatique (Qui sommes-nous?) en collaboration avec l'Université de Lausanne et le CHUV – dans le cadre de l'initiative SantePerso (www.santeperso.ch).
(Les membres Expériment@l-Tremplins peuvent obtenir ces articles…).
Références:
- Stratton, M. R., Campbell, P. J., & Futreal, P. A. (2009). The cancer genome. Nature, 458(7239), 719‑724. https://doi.org/10.1038/nature07943
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